多数癫痫病人的脑组织存在有病理转变，即所谓“癫痫病灶”。
    在“癫痫病灶”中，神经病理改变重要为限局性硬化、限局性瘢痕(沾染或外伤后)、脑膜粘连、新生物等导致局部脑组织崩解，供血阻碍，神经细胞外液成分改变，组织构造发生紊乱，从而使细胞的生理功效、生物化学结构和新陈代谢等发生异常，给部分细胞电生理改变打下基础。
    典范的大脑皮层癫痫病灶有核心区跟环形旁边带，代之以瘢痕组织和胶质细胞增生，已不存在神经的高兴性，所以也不电运动。环形中间带的神经细胞数量减少，并因为供血不足及代谢杂乱而产生变性，具备适度高兴性，有异样的电活动，是引起癫痫放电的区域。其异常放电通过四周畸形脑组织而传布，这就形成了癫痫发生的病理基本。